SeqBench

打开 SnapGene .dna 文件

拖入 .dna 文件,读取序列、特征、颜色和引物,并导出 GenBank / FASTA。

收到同事或 Addgene 发来的 SnapGene .dna 文件,手边却没有能打开它的软件?.dna 是没有公开规范的二进制格式,用文本编辑器打开只会看到乱码。把文件拖到本页,SeqBench 用自己的解析器读取它:完整序列、环状还是线性、每个特征的类型、范围、方向、保存的显示颜色和限定符(包括跨越原点和剪接的特征),以及文件中保存的引物。整条记录可以导出为 GenBank,序列可以导出为 FASTA——NEBuilder、pLannotate 等常用工具不接受 .dna,转换成 GenBank 后即可直接使用。文件在当前浏览器标签页中读取。

工具界面目前为英文:拖入文件或粘贴序列即可,结果中的数字与图表和英文版完全相同。

Drop a SnapGene .dna file hereor click to browse

Design, edit, and verify complete constructsSeqStudio combines sequence editing and annotation, plasmid maps, primer/cloning/CRISPR design, Sanger verification, and GenBank/SnapGene files in one workspace.

使用步骤

  1. 1把 .dna 文件拖到下方,或点击选择文件。
  2. 2查看图谱、特征表和引物。
  3. 3需要时导出 GenBank 或 FASTA,或在 SeqStudio 中继续编辑。

常见问题

可以把 .dna 文件转换成 GenBank 吗?

可以。打开文件后选择导出 GenBank,特征、方向、颜色和限定符都会写进 GenBank 记录;只需要序列时导出 FASTA。

打开 .dna 之后还能做什么?

可以在 SeqStudio 工作台中继续编辑序列(插入、删除、替换碱基时特征自动跟随),做酶切和虚拟凝胶,或者把它作为参照,比对 Sanger 读段和全质粒测序结果。

更多中文入口见 SeqBench 中文。